Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMIGD2Q96BF3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms