Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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