Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AVL9Q8NBF6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms