Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP3Q8IZU3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYCP3Q8IZU3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms