Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPAS3Q8IXF0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms