Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT28Q7Z3Y7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms