Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRCQ7RTU9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms