Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCF23Q7RTU1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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