Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTOP1Q7RTM1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms