Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC9Q6ZRR7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC9Q6ZRR7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms