Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
METAP1DQ6UB28 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
METAP1DQ6UB28 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms