Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms