Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VIRMAQ69YN4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms