Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms