Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CARMIL1Q5VZK9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms