Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RNF220Q5VTB9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RNF220Q5VTB9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms