Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD1Q5SYB0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms