Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms