Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms