Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SP6Q3SY56 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms