Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PROX2Q3B8N5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms