Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ISXQ2M1V0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ISXQ2M1V0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms