Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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