Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKN3Q16667 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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