Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDB1Q16531 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDB1Q16531 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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