Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS72Q15906 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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