Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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