Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPEGQ15772 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms