Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNHIT3Q15649 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNHIT3Q15649 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms