Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRADDQ15628 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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