Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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TAF1CQ15572 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1CQ15572 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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