Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB35Q15286 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB35Q15286 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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RAB35Q15286 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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