Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MLC1Q15049 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MLC1Q15049 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms