Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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