Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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