Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERV3-1Q14264 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERV3-1Q14264 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms