Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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