Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKD2Q13563 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
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