Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMS2P3Q13401 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms