Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF1Q13351 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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