Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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