Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN3Q13286 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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