Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NME3Q13232 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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