Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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RPA4Q13156 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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