Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALCOCO2Q13137 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALCOCO2Q13137 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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