Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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