Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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