Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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