Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB40BQ12829 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms