Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TROQ12816 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TROQ12816 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TROQ12816 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TROQ12816 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TROQ12816 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TROQ12816 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TROQ12816 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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